In SEKEMs Medical Center sollen Kinder und Jugendliche eine ganzheitliche medizinische Versorgung erhalten. Dazu wurde zunächst ein Dokumentationsheft entwickelt, das ÄrztInnen und Krankenschwestern eine Orientierung geben soll. Es beinhaltet Elemente aus den ägyptischen und deutschen Vorsorgeprogrammen für Kinder und konzentriert sich zunächst auf zwei Schwerpunkte.

• Früherkennungsuntersuchungen: Kleinkind bis zum 6. Lebensjahr werden regelmäßig untersucht und in seiner Entwicklung begleitet. Die Eltern erhalten gezielte Beratung zu Themen wie Stillen, Wärmehaushalt, Ernährung, Rhythmus, Bewegung, Kommunikation, Spielen, Bildung oder Medien. Bei Bedarf werden auch ErzieherInnen oder LehrerInnen in die Beratung einbezogen.
• Ärztlichen und therapeutischen Betreuung während der Schul- und Ausbildungszeit: Es werden Workshops für Eltern und LehrerInnen organisiert zu Themen wie altersgerechte Ernährung, Schlafen und Wachen oder den Umgang mit Allergien und Infektionen. 

Das Programm richtet sich an alle Beteiligten, einschließlich der ÄrztInnen, Krankenschwestern und TherapeutInnen, eine Schule. SEKEM leistet die komplette Finanzierung für die Kinder der Mitarbeitenden da die ägyptischen Krankenversicherungen keine Vorsorgeuntersuchungen oder präventive Maßnahmen abdecken.